I 1858 finner noen sjømenn en hodeskalle i Antarktis. 150 år senere dukker en lik hodeskalle opp i Colorado, USA. Dirk Pitt er i Antarktis for å forske på det sunkne riket Atlantis. Da dukker en ubåt opp og åpner ild mot ham. Pitt er overbevist om at disse to hendelsene henger sammen, og begynner å undersøke dem. I dramaet som rulles opp, møter han de verste motstanderne han hittil har stått overfor.